鳥(niǎo)類(lèi)起源于恐龍的觀點(diǎn)雖然已經(jīng)獲得了古生物學(xué)界的廣泛承認(rèn)，但仍然有鳥(niǎo)類(lèi)學(xué)家對(duì)此提出質(zhì)疑，并堅(jiān)持傳統(tǒng)的鳥(niǎo)類(lèi)起源于三疊紀(jì)的槽齒類(lèi)爬行動(dòng)物的假說(shuō)。 他們認(rèn)為獸腳類(lèi)恐龍與鳥(niǎo)類(lèi)的相似性?xún)H僅是表面上的，是不同門(mén)類(lèi)的生物由于生活環(huán)境和生活習(xí)性的相似而出現(xiàn)的演化結(jié)果。如中生代的魚(yú)龍、現(xiàn)代的鯨和魚(yú)，它們相互之間的親緣關(guān)系很遠(yuǎn)，但由于都生活在水里，適應(yīng)游泳生活，所以形成了非常相似的體形。 鳥(niǎo)類(lèi)的翼與獸腳類(lèi)的前肢雖然都有三指，但實(shí)際是不同的，獸腳類(lèi)是第1、2、3指（第4指和第5指已消失），而鳥(niǎo)類(lèi)則是第2、3、4指（第1指和第5指已消失）。他們認(rèn)為獸腳類(lèi)已經(jīng)消失的第4指不可能再重新獲得而進(jìn)化成為鳥(niǎo)類(lèi)的第4指。 還有就是認(rèn)為與鳥(niǎo)類(lèi)具有很多相似之處的小型獸腳類(lèi)恐龍出現(xiàn)較晚，只可以追溯到大約1.15億年以前，而始祖鳥(niǎo)則生活在1.5億年以前，所以這些小型獸腳類(lèi)不可能是鳥(niǎo)類(lèi)的祖先。 此外，獸腳類(lèi)的鎖骨與鳥(niǎo)類(lèi)的叉骨不相像，鳥(niǎo)類(lèi)復(fù)雜的肺臟不可能起源于獸腳類(lèi)的肺臟也都是反對(duì)者的理由。 然而，反對(duì)鳥(niǎo)類(lèi)起源于小型獸腳類(lèi)恐龍的科學(xué)家也沒(méi)有能夠找到與鳥(niǎo)類(lèi)相似的、有可能是鳥(niǎo)類(lèi)祖先的三疊紀(jì)時(shí)期具體的槽齒類(lèi)動(dòng)物。 看來(lái)，鳥(niǎo)類(lèi)起源于小型獸腳類(lèi)恐龍的假說(shuō)雖然在古生物學(xué)界占了上風(fēng)，但也還沒(méi)有得到科學(xué)界完全的公認(rèn)，這個(gè)學(xué)術(shù)爭(zhēng)論還將繼續(xù)下去。但是，隨著更多證據(jù)的發(fā)現(xiàn)和更深入的研究，相信不需要太長(zhǎng)的時(shí)間，鳥(niǎo)類(lèi)起源的自然之謎必將會(huì)被揭曉，被我們?nèi)祟?lèi)最終認(rèn)識(shí)。